有敌军入侵的消息几乎在烈焰升起的同时传到了本能寺。本能寺的寝殿内，也传来了和历史上一样的询问声：
“定然有人反叛，去，看看叛乱者是谁。”
小姓领命而去，不一会就匆匆跑回。
“桔梗旗，是明智日向守的部队！”
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“包围本能寺，任何一个街道都不要放过，封锁鸭川西岸本能寺周围所有出入口，再切断从本能寺前去二条城的路径。”
此时，明智光秀正策马奔驰在燃起熊熊火光的京都内，对快速移动着的明智军们下令道，“对手是织田信长的话，半点差池都不能有。”
此时，由于京都大火，已经有无数居民从睡梦中醒来开始逃难，慌乱的京都里人仰马翻，大有十几年前三好义贤火烧京都时的乱象。
“殿下，您知道您到底在干什么吗？”虽然在执行命令时没有丝毫犹豫，但是脸色铁青的斋藤利三还是没有放弃劝谏明智光秀，“您这是要谋反吗？”
“我要给红叶复仇。”明智光秀神色平静得令斋藤利三害怕。
“您这个时候反，除非能够在这里杀了织田信长让天下再次大乱，否则明智家就要万劫不复了。”斋藤利三冷汗直冒，声音都有些变了调。
“我已经把孩子送到堺町了，此时此刻估计已经到了吧。”明智光秀非常从容不迫地回答道。
“殿下…您到底是疯了还是没有疯？”斋藤利三彻底放弃了理解明智光秀的努力，只是干笑了两声，“在下是懂不了您了。但是在下现在只懂一个道理——事已至此，我们必须要在这里杀了织田信长了。”
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明智军的部队快速移动，很快就完成了对本能寺的彻底包围。此时，派去南方的斥候回报，驻扎在东寺一带的蒲生氏乡率领的织田家旗本队似乎已经察觉到了危险，开始集结了。索性他们人数不多，应该奈何不了明智军。
明智军已经先本能寺的守军一步，夺下了寺外马厩的控制权，而明智家的骑兵也快速堵塞了本能寺的出口，将试图逃跑的织田军给全部赶回了寺内。随后明智光秀亲自下马入寺，指挥对寺庙的围攻。正如情报上所显示的那样，本能寺内只有织田信长身边的上百小姓，甚至连守卫都没有多少。织田家的所有忍者基本都被派出去弹压因为因谋杀雨秋平而起的诸多谣言与骚乱，以至于京都异常空虚。这个一贯自信的魔王，眺望着远方的同时，却忽略了脚下的危险。
明智光秀入寺时，寺庙的外围已经被基本压制，织田信长小姓们的尸体零落地倒在各种地方，其中还有不少明智光秀认识的人。而此时，明智军正在围攻本能寺内的那处长廊，织田家的小姓们正在奋力抵抗。边上的几个回廊已经被火焰点燃，映照出两军搏杀的模样。
“织田信长找到了吗？”明智光秀向正在领军围攻的妻木广忠问道，后者则一脸困惑地连连摇头。
“没有看到织田信长，但是却出现了不少织田信忠的侍卫，非常奇怪。”妻木广忠双眉紧锁，握着刀的手把武士刀反复做着拔刀收刀的姿势，看起来就很烦躁。
“织田信忠？”就在明智光秀感到诧异的时候，走廊上却突然想起了一声低吼。
“吾乃织田城介信忠，尔等兵士，何故作乱！”
织田信忠的一声大吼立刻让他成为了战场上的焦点，除了正在生死搏斗的人之外，其余的人都将视线投向了一身武士服、手持刀鞘的织田信忠身上。他此刻正屹立于长廊上，对着明智军的士兵们大吼道。
“为红叶殿下报仇雪恨！”明智光秀清了清嗓子，同样朗声应道，“叫织田信长出来，我要亲自结果了他！”
“明智殿下？”认出了明智光秀声音的织田信忠大吃一惊，随后又环顾了寺内一圈，低声确认道，“所以这不是兵士作乱，而是您主导下明智家的叛乱吗？”
“为友复仇，为义讨逆，为万民请命，何来叛乱一说？”明智光秀也不顾自己火光下的女人妆容是否引起了众人的意外，高声应道，“不必多说，快叫织田信长出来！我只要他一人性命，与他人无关！”
“明智殿下！红叶殿下是我一直一来最为敬重的长辈，他也帮了我许多，我一直铭记在心！他的事情，我也深感遗憾，日后定当想办法替他讨个说法。若是没办法为红叶殿下昭雪，我在此发誓，愿切腹明志！只是征伐雨秋一事，也是因为雨秋家的过激反应而起。雨秋家杀害了本家忍者和旗本，若是不做表态，织田家实在颜面扫地，还望明智殿下谅解！明智殿下的愤怒，我也感同身受！还请您在此收兵，我愿以武士的荣誉保证对明智军此事既往不咎！”织田信忠言辞恳切，同时非常低姿态地向明智光秀行了一礼，周围不少明智军的士兵见状都有些犹豫，可是明智光秀却是连半点动摇都没有，直接从身旁的一个铁炮足轻手里拿过已经点燃火绳的铁炮，就对准了织田信忠，同时厉声道：
“多说无益，叫织田信长出来！”
“断无可能！”织田信忠见明智光秀心意已决，也就放弃了劝说，而是缓缓地从腰间抽出了武士刀，沉声吼道，“明智殿下若是一心谋反，那我们织田家也只有奉陪到底了！”
话音未落，明智光秀已经扣响扳机。织田信忠侧身要躲，却被击中肩膀，跌倒在了地板上，被几个小姓仓促扶回室内。看到局面进展到如此地步，明智军的士兵们也都明白了此事绝无善了，一个个大吼着冲向了内室。织田家的小姓奋力抵抗，可是寡不敌众还是渐渐不支。最后，内室内燃起了熊熊火光，隐约可见有人切腹。
“活要见人，死要见尸！”明智光秀并没有任由大火燃烧的兴趣，而是立刻下令部下灭火搜尸。在最后的内室里，明智军抢出了二十几具尸体，其中既有织田信长的小姓也有织田信忠的小姓，还包括了织田信忠本人的尸体——他在切腹自尽后由手下完成了介错，尸首被藏在地板下，也被明智军给翻了出来。
唯独没有找到织田信长。
“之前有漏人出去吗？”明智光秀看着那一具具被烧得发黑的尸体，冷声问道。
“绝对没有。”负责周围封锁的斋藤利三信誓旦旦地保证道，“一只苍蝇都没有飞出去。”
“但茶室边的墙壁上有个大洞。”妻木广忠从走廊上巡视归来，指了指本能寺内茶室的方向，“不知道为什么，可能有什么猫腻。”
“那就继续搜，把寺内搜个底朝天。”明智光秀挥了挥手，士兵们立刻开动起来。可是哪怕他们搜遍了本能寺内的每一个角落，甚至把所有的地板都撬开了，也没能找到织田信长的踪迹。
眼看着天色逐渐要蒙蒙亮，已经到了凌晨，明智光秀也愈发不安起来——难道织田信长不在本能寺吗？怎么可能？自己在傍晚还特意派出使者进京见了织田信长，确认了他在入夜前还是在本能寺没错——难不成都已经天黑了却要换个地方睡觉不成？
就在这时，又一个南方的斥候赶回。
“报！殿下！”那个斥候在寺门外翻身下马，快速走向明智光秀，“驻扎在南方的织田家旗本队并没有攻击的意思，反倒是缓缓向南撤出京都了。”
“太好了。”斋藤利三和妻木广忠闻言都是长出了一口气，“给我们留了更多时间去搜织田信长。”
然而明智光秀转念一想，却忽然意识到不对，脸色也瞬间阴沉了下来。
“这哪里好了？”明智光秀倒吸了一口凉气，狠狠地用手锤了下廊柱，“如果织田信长真的在本能寺内，此刻那些旗本肯定会发了疯地冲过来救人吧？可是他们现在连织田信忠都不救，也要保证自身的安全向南边退去，说明队伍里肯定有比织田信忠还要重要的人物啊。”
明智光秀的话让寺内的气氛瞬间凝固了，大家都明白这意味着什么——织田信长大概率已经在那队旗本里了。
怎么可能…
明智光秀只觉得从头到脚被人浇了一盆冷水，在熊熊火光映照下的夏夜里却只感到彻骨的寒冷。织田信长怎么可能不在本能寺内就寝，反倒跑到东寺去了呢？
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四个时辰前，天正十年（1582）6月16日傍晚，京都东寺。
“田沈先生，请恕我们只能掩护您到这里了。”
德川家使者团的大久保忠佐非常歉意地向田沈健太郎微微行了一礼，“按照规定，入夜后我们使者只能下榻在东寺一带，不能再继续往京都里面走了。而且再往里走，您刺杀后，德川家怕是也脱不开干系了。”
“已经足够了，多谢德川家的诸位。”田沈健太郎一边卸去自己身上穿着的印有德川三叶葵的衣服，一边换上了一身黑衣，“替老夫混过检查最严格的京都外沿就足够了，这里面忍者数目并不多。”
“那您之后打算怎么办？”大久保忠佐看着连佩刀都没有带的田沈健太郎，忧心忡忡地低声道：“您只有一个人而已。”
“一个人就够了。”田沈健太郎留下这句话后，便快步消失在夜色里，直奔本能寺而去。