就在商毅回到杭州的第二天，吴甡和卢九徳一行迎接遗诏、玉玺的人员，也到达了杭州。
接到通报之后，商毅立刻下令，在杭州隆重的接待了吴甡一行，当然朱媺娖、朱媺婕、王徳化、沈扬、曾化龙、孟宏恭等人也全都随他一起出迎。
吴甡就在北京为官，而卢九德也在北京干过许多年，因此对出迎的众人都不陌生，一见之后，也就基本能够断定，商毅所说的遗诏是不可能说谎的。
虽然两人都是各怀心事，但首先参见了两位公主，当然见面之后，都放声大哭，结果也惹得朱媺娖、朱媺婕也哭泣不止。而商毅等众人也只好装腔作势的陪着哭了一会，然后劝住两人，又叫宫女送两位公主去休息。这才又带着两人，去看了崇祯的遗诏和玉玺，当然按照常理，吴甡和卢九徳现在是不能看遗诏的内容，不过能够确认玉玺是真货不假，于是又是一阵痛哭。
好不容易等这一切程序演完之后，商毅才下令大摆盛宴，为南京的两位上差接风，在宴席间，商毅才把自己到北京一行以及崇祯传下遗诏的经过，当然还有吴三桂引清军入关的事情等等，都详细的讲说了一遍，当然隐瞒了抢到巨额财富的事情。吴甡和卢九徳也听得目瞪口呆，没想到商毅真有这么大的胆子，不但敢率军北上勤王，还敢主动进攻北京。而且还是二次进入北京。
听完了商毅的讲说之后，吴甡立刻举杯向商毅，道：“当日反贼势大，满朝具惊，朝廷下诏命天下兵勤王，却无人响应，但只有以恒一人敢率军北上，深入京师重地，实在是愧杀我辈。真是一身是胆，令人可敬可佩，若我大明的武将都有以恒的胆识，也断不会到此地步，曰后朝廷中兴，收复失地，全在以恒身上。本官当敬以恒一杯。”
商毅也举杯回敬道：“在下能有今日，全是阁老当初荐举提拔，当日南下，如果不是阁老赏识，那有末将今日，阁老之恩，末将末齿难忘。”
吴甡听了，也微微一笑，两人各自将杯中的酒一饮而尽。
而另一边卢九徳也大为安心，虽然没有现在看到遗诏的内容，但刚才也听商毅讲了，北京城破之后，太子三人都被李自成所抓，他两次攻入北京，都没用救出太子等三人，想来这兵荒马乱的时候，三个十几岁的小孩子，又是一向养尊处优，怎么能生存下去，现在八成己是凶多吉少了。没有太子等三人，自然也就没有人能威胁到朱由崧的位置，因此卢九徳也终于放了心，然后也夸讲了商毅几句，同时两个人也催促商毅，尽快保护遗诏和玉玺、公主到南京去，好向天下宣布遗诏的內容，以安人心，商毅当然也是满口答应。这个酒宴也是尽欢而散了。
宴会结束之后，商毅给他们安排下住所，让他们一行人休息。而就在当晚，商毅来到了吴甡的住处，以述旧为由，和他私下商谈。
因为在酒席宴间，两人那一番对话，互相心里都有数了，吴甡也早料到商毅来，因此一直也在等着。其实吴甡这次到杭州来，包括提出这个建议，都是另有一番目地的。
北京被攻破的消息传到南京之后，南京朝廷为立福立潞立桂，闹得沸沸扬扬，东林党人都表现是十分活跃，只有吴甡一改初到南京时锋芒毕露，收敛了许多，很少主动发表什么意见。吴甡虽是内阁大学士，督师，但北京朝廷一灭，这些都成了虚衔，因为吴甡督师的时间也不长，没有陪养出自己的嫡系力量，原来的部下黄得功、刘良佐等人也都投到了马士英那边。而现在的实际权力，都在南京官员手里。
虽然在名议上，商毅还是吴甡的部下，但吴甡心里清楚，自己根本管不住商毅，但吴甡还不能让别人知道这一点，在表面上还要维持着自己能够调动商毅的样子，因此只有这样，吴甡才能够在新朝中立足，因此在当初马士英和江淮四镇宣布拥立朱由崧时，有人建议调商毅率军入南京与其抗衡，但吴甡马上站出来反对，就是怕自己这点底细被泄漏了。
但吴甡心里也知道，时间长了，肯定是瞒不过去的，因此这次到杭州来，吴甡根本就不关心遗诏的真假和內容，而主要是希望和商毅达成一个协议，互相扶持，互惠互利。因为吴甡也相信，现在的商毅同样也需要一个能在朝中帮他说话周旋的大臣。这样的结盟，对两人都好。
因此两人见面之后，吴甡道：“以恒，要是朝廷当日早调你率军救援京师，也不会落到如今这番田地，实在是令人叹惜啊。”
商毅当然听得出吴甡是话里有话，道：“可恨当时都是陈演、魏藻德这批无能之辈把持朝政，不仅害了先帝，同时也害了大明江山，若是当时阁老在朝，也断不会出现这般结果。”
吴甡心中一动，看来商毅果然是很上路，于是又道：“事情都己经到了这个地步，还说这些有什么用，只是现在我大明只剩这半壁江山，北面又有流寇、北酋虎视眈眈，我素知以恒善能用兵，骁勇善战，因此以后还需要以恒多多尽力，日后这中兴第一功，非以恒莫属。”
商毅道：“阁老太过讲了，末将为国尽忠，自当万死不辞，只是恕末将直言，现在朝中朋党相争，互相争权夺利，而福王监国又暗弱无察，怕只怕大将征战于外，而权臣进馋于内，倒头来落得个不得善终，岂不冤枉，因此末将心中，也是十分惶恐啊。”
吴甡点了点头，慨然道：“以恒请尽管放心，朝中虽有小人，但君子犹在，小人虽为祸水，但有君子可做堤坝，侠其不致为害，也绝不会让以恒受小人中伤。”
商毅摇了摇头道：“小人固然难缠，但所谓正人君子，恐怕也未必真能持正，史尚书到是真君子，只可惜太迂直了，因此满朝之中，末将能使得过的，也只有阁老一人而己。”
话说到了这个份上，吴甡也明白商毅的用意，他只是想和自己结盟，但并不想和整个东林扯上关系，虽然吴甡对商毅说东林党未必真能持正，觉得有些刺耳，但这样反而更好，自己在东林，甚致在南京朝廷的地位，就显得更为重要了，因此也正色道：“好，只要有老夫在朝中一日，必会全力为以恒抗挣，请以恒尽管放心。”
商毅也正色道：“有阁老这一句话，末将自然也就再无疑虑了。”
尽管在另一时空里，吴甡在这个时候己经退出了政治舞台，但商毅和吴甡同事过一段时间，加上历史的评价，也知道和史可法、钱谦益相比，吴甡在政治的见解，施政能力，灵活度等方面都要比他们强得多。商毅当然清楚，虽然自己不想参与朝中的斗争，但也不可能完全避免得了，这次王维如出任浙江巡抚，也就是一个例子，因此如果真的和吴甡结成同盟，在朝中有一个得力的同盟者，宫里又有王德化，到是可以为自己减去许多麻烦。
随后商毅拿出两份遗诏，请吴甡过目。第一份的内容基本都在吴甡的意料之中，第二份到让吴甡有些意外，不过看完之后，吴甡笑道：“原来如此，到是要恭喜以恒了。”
商毅也道：“此事还请阁老帮忙维持。”
吴甡大笑道：“好说，都包在老夫身上。”
第二天，商毅就开始做进京的准备，其实他从山东回到杭州之后，就己经开始着手准备了，现在各项工作也都差不多少。因此商毅也决定，就在三天以后动身。
而在商毅去苏州期间，随船队一起到港的日本朱印船也和商家军达成了交易，将所带的珫磺、铁、铜还有六十柄日本刀，都买给商家军。
商毅回来之后，大野殿守又亲自来拜见商毅，同时送上了一把上品日本刀，百两黄金，还有一些贵重的礼物，一来是感谢商毅购买了大量的货物，另一方面也是请求商毅能够允许他们在杭州多停留一段时间，好让他们将其他的货物卖完，另外也还想在杭州购买一批货物运走，因此也想请商毅允许他们上岸居住。
日本人提出的这个要求也很合理，而且商毅也希望与日本建立贸易来往，因此想了一想之后，也答应下来，只不过强调他们要尊守中国的法律，否则必将严惩，然后就安派人员去帮他们张罗住处去了。
商毅对别的东西到不在意，但对曰本刀却十分喜欢，在后世，商毅也练过日本刀，知道虽然日本刀的刀身窄而细长，看上去似乎轻很脆弱，其实入手感很重，而且韧性很强，可以和棍斧一类重武器硬碰，也不用担心被拆断。既可做剑刺，也能用于砍、劈，而且因为刀身略带弧度，因此在砍、劈时杀伤力极大。而且大野殿守送给商毅的这柄刀属于上品一类，一般是不作出口，就是在日本国内，也只有大名、家老、大臣一类的人士才有资格使用。其价值至少在数千两白银。
商毅穿越带的军刀在一定呈度上也吸收日本刀的优点，只不过军刀太短，单拉独斗到就可以，但在战场上使用起来很不应手，虽然商毅基不不用亲自上阵杀敌了，但就是当指挥刀用，也不够气派。也这把曰本刀到是正合他使用。因此也不客气的礼物都收下了。