那知就在绍武朝廷內部还讨论商议的时候,金声桓己经等不及了, 带领着人马己经退进到汀州府。
那知郑成功可不是个只会说不会做的人，早就在汀州府里埋伏下了人马，金声桓的部队一到，立刻就遭到郑牟的袭击，结果被打得大败，四散奔逃，幸好是金声桓、王得仁颇有些勇力，带领着数千残兵杀出重围，躲进黄公岭去了。随后郑成功又上书绍武朝廷，称金声桓无令进犯汀州，意欲不轨，被自己岀兵杀败。
朱聿鐭和苏观生等人听了，虽然恼火，但也没有办法，毕竟郑成功说的也不无道理，金声桓退进福建，确实是没有任何人下令。金声桓又是降将，说他意欲不轨，也并不是说不通的。而且现在事情也己经发生了，绍武朝廷也不敢责怪郑成功，只好命令苏观生去调解。
经过了好一番功夫之后，郑成功终于接受了金声桓投降绍武朝廷的事实，但禁止金声桓部驻扎在汀州府，而是命金声桓移军邵武府。因为邵武府的地域不大，只有汀州府的一半，而且紧邻建宁府，处在商家军的左右夹击，把金声桓扔在这里，当然是有意打压他，不让他有东山再起的机会。另一方面绍武朝廷也觉得让金声桓守在邵武府，可以挡住建宁府的商家军进攻，而且离福州也比较近，因此也认为这样的安排也不错。
但这时金声桓连遭惨败之后，部下只剩四千多人，现在回想一下，要是直接投降商家军，弄个团长也能管着三四千人，到头来除了有一个公爵的虚名之外，啥都没了，因此金声桓连肠子都悔青了。但现在能有一块安身之地就己经不错了，那还有资格挑挑拣拣，金声桓也二话没说，老老实实的带领着余部去了邵武府。
而在这段时间里，罗远斌也占领了江西省的全境。因为商毅的命令只是江西，不包括福建，因此商家军也沒有继续进军，在江西省驻扎下来。而绍武朝廷见商家军并没有进攻福建的意图，也就放心下来，然后又把商家军的事情放到一边，开始琢磨怎样利用金声桓，来牵制郑成功。
到这时商毅的扩展计划中，江南的部份己经全部完成，现在商毅的统制范围己经包括湖南、江西、浙江三个省的全部地区。
另外在南方居然还发生了一个小插曲, 广东的尚可喜宣布，反清复明，奉立鲁王朱以海为帝，
原来尚之孝从江西撤回到广东之后，尚可喜也十分紧张，因为一但商毅打完了觉罗巴哈纳和金声桓，下一步要收拾的，恐怕就是自己了，虽然说自己现在坐镇广东，手里有六七万大军，但尚可喜还是颇有自知之明，几十万清军都打不也商家军，何况是自己这六七万人呢？
因此尚可喜首先准备联合觉罗巴哈纳，共同对付商家军，但他又不希望觉罗巴哈纳放到广东省境內来，只能让他们在赣州拒守，却没想到金声桓杀了觉罗巴哈纳，投降了绍武朝廷，江西之地也被商家军尽占。尚可喜也十分后悔，早知如此，就该让觉罗巴哈纳进广东来，在自已的眼皮低下，金声桓决不敢乱来。
但这时后悔也晚了，而且尚可喜又听说，虽然金声桓己经投降了绍武朝廷，但商家军仍然不放过他，照打不误，因此让尚可喜打消了也投降绍武朝廷，以拒商家军的想法，而这时商家军的势力己经和广东交界，于是尚可喜一边调兵遣将，防守广东的各交通路口，一边又招集手下的众将，商议对策。
其实也没有好商议的，打肯是打不过商家军了，只能选择跑，因此也有人建议，不如乘船从海上逃跑，返回江北去。但一来海路漫漫数千里，却了福建以外，尽是商家军的地盘，谁知途中会发生什么变故，而且另一方面，就这么轻易放弃了广东，尚可喜也还有点舍不得，能够得到一块地盘可不容易，现在屁股还没有坐热乎，就要放弃，尚可喜一时也下不了这个决心，毕竟商家军也还没有兵临城下来。
而这时又有消息传来，商家军只占领了江西，并没有继续进攻福建，看来对绍武朝廷还是有几分顾忌，而尚可喜也由此想到了一个办法。原来在尚可喜进取广东的时候，抓住在广东广西交界处存身的鲁王朱以海，以及鲁王监国的一些官员，因为朱以海的身份不同，因此尚可喜也要向南京的多铎请示，如何处理朱以海，但一直没有得到回复，结果也沒有杀朱以海，而是将他关押在广州直到现在。
尚可喜的办法是把朱以海和鲁王监国朝廷的官员都放出来，拥立鲁王在广州登基，也成为南明的一部份，而自己摇身一变，也就成了明军，如果商毅对明室的政权有几分顾忌，那么就可以利用朱以海当挡箭牌，挡住商家军对广东的进攻，但万一要是商毅六亲不认，一定要占领广东，那么自巳也只能选择最后一招，等商家军打到广州城下的时候，就乘船从海上逃跑。
就这样当了几个月阶下囚的鲁王朱以海以及下属的十余名官员，包括张煌言、张名振、朱大典、张国维等人，也都被尚可喜放出，恭恭敬敬的待若上宾，同时尚可喜还表示，自已愿意弃清降明，并拥立朱以海称帝，就在广东建立新朝廷。
朱以海当时就傻了，因为这事情实在是太意外了，简直就是太阳从西边出来，因此怔了好半天之后，朱以海才咬了咬自己的手指头，终于证明自己是没有做梦的，原来天上真的掉下馅饼来。而紧接着朱以海就是一阵狂喜，吓得尚可喜赶忙又安抚，生怕朱以海受不了这种刺激，再疯了过去，自己可就真的在沒有办珐了。
好在是这两年来，朱以海东奔西逃，也算是几起几落，心里承受力也比过去强得多了，因此才算是稳定住了心神，不致于教尚可喜的这一番心血白费。
虽然张煌言、张名振等人有尚可喜的用心还十分怀疑，但朱以海己被称帝深深吸引住，因此也不顾众人的反对，就在被尚可喜释放之后的第三天，在尚可喜的扶植下，正式称帝，定国号永安。封尚可喜为太师、永宁王，以张国维、朱大典为内阁大学士、督师熊汝霖、张煌言为兵部尚书。
商毅收到些消息的时候，也不禁十分好笑，在另一时空里本来只是打酱油的绍武朝廷居然还真坐稳了，一直没有称帝的朱以海也终于过了一把皇帝的瘾，而赦赦有名的大汉奸尚可喜竟然也干起了反正的事情，一跃而变成了明朝的臣子，看来自己扇动翅膀引起的这场风暴的威力可不小，己经有很多人的结果都发生了变化。
现在的南明，成了永历、永安、绍武这三个朝廷并架齐趋，三足鼎立的态式。再加上尚未分出胜负的四川、北方的清廷和自巳，中国大地上实际出现了六个相对独立割据的势力，但既不是南北对持，又不是东西相争，这可是在任何历史时代都没有出现过的局面，不知道后世会对这段历史时期使用一个什么称呼呢？
而这里面最让商毅感觉到有趣的，还是郑成功和绍武朝的关糸，在另一时空里郑成功可是南明后期抗清的一面光辉旗帜，被后世形容是忠义的像征，但现在居然就开始和绍武朝廷产生了矛盾。而且还干了不是忠臣应该干的事情来。
不过想想也并不奇怪，尽管郑成功在抗清的立场十分坚定，对明朝的忠心也不容质疑，而且性格刚毅，百折不挠是郑成功最大的优点，但同时也是他最大的弱点，因为一但刚毅过头也就成了固执，因此郑成功的弱点也不少，遇事容易冲动，往往凭一时的好恶而不计后果地处理问题，缺乏作为统帅人物必需的全局观念，和宽容心怀。
在另一时空里，尽管郑成功自起事之后，一直都奉立距离自己较远的永历朝廷为正朔，而没有奉立近在身边的鲁王监国，除了因为鲁王监国曾和隆武朝廷恶交之后，也有很大一部份原因恐怕就是不想有人在身边管着自己。在后来，没有配合李定国进攻广东，也有这个因素在里面。
实际永历朝廷也从来就沒有能够真正指挥过郑成功，因此郑成功一直都是作为一股独立的割据势力存在，我行我素，但也正因为如此，郑成功才能无所牵挂的按自己的计划行事，不必分散精力去应付那权力纷争，结果势力、影响力、建立的功绩，也一直都比受制于永历朝廷的李定国大。
而现在郑成功才刚刚起事，政治上还不成熟，就十分轻率的把绍武朝廷接到福建奉立，从而背付起这个沉重的负担，以后遇到的麻烦也是可想而知道。
但这些问题是该郑成功去头疼，还轮不到商毅操心，现在江南地区基本平定了下来，而南京的各项工作也在李岩的指挥下，有条不紊的开展起来，商毅也觉得自己应该返回杭州去了。